《表3 可能靶向VDR的miRNAs初步筛选结果》

《表3 可能靶向VDR的miRNAs初步筛选结果》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《结核病患者中靶向调控维生素D受体的microRNA的初步筛选》


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注:targetscan,starbase,miRDB3个miRNA数据库交集:靶向结合VDR基因3'UTR的33条miRNAs。其中:hsa-miR-326、hsa-miR-654-5p有意义,且在肺结核病中差异表达上调

为探究差异表达谱中的miRNAs靶向VDR的特征,本文又通过生物信息学预测方法,从众多miRNA数据库中选择常见的3个数据库:targetscan(http://www.targetscan.org/vert_72/)、starbase(http://starbase.sysu.edu.cn/)、miRDB (http://mirdb.org/),利用3个miRNA数据库和VDR转录本序列进行BLAST比对,按照碱基互补配对原则,从3个数据库分别获得理论上靶向结合VDR的miRNAs分别为1 587、151、254条,三者取交集为33条,进一步分析发现,这些miRNAs与VDR mRNA 3'UTR有1个或多个结合位点,见表3。将差异表达谱与预测miRNAs取交集后,筛选出了差异表达且靶向VDR且有确定功能的miRNAs:hsamiR-326、hsa-miR-654-5p。由此设想,上述两条miRNAs有可能是诊断和辅助治疗结核病的新靶点。