《表2-2 PROMO 3.0.2预测结果》

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《Nogo-A启动子的地塞米松结合区域以及相关转录因子的研究》


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PROMO 3.0.2的预测结果共有88个,主要包含GATA-1、Ap-1、AR等,见表2-1、2-2。Patch 1.0预测Nogo-A基因共有116个转录因子结合位点,见表3。据此推测Nogo-A基因转录因子结合位点至少包含GATA-1、Ap-1和AR,此为2个软件的共同预测结果,相对可靠。结合2个软件预测结果,经人工筛选去重后,最终确定了84个可能的转录因子,即AP-1、AR、C/EBPalpha、C/EBPbeta、CAC-bindingprotein、CACCC-bindingfactor、CAR、CCAAT-bindingfactor、c-Ets-1、c-Ets-2、c-Fos、c-Jun、c-Myb、COUP-TF1、CP1、CRE-BP1、deltafactor、EBP-80、Elk-1、ER-alpha、ER-beta1、FOXM1a、FOXM1b、FOXP3、FOXP3、GATA-1、GATA-2、GATA-3、GATA-4、GR-beta、Hi NF-D、Hi NF-M、HNF-1A、Hi NF-P、HNF-3B、Hp55、Hp65、Hrp F、IRF-1、IRF-2、ISGF-3、LBP-1、LF-A1、LXR-alpha、LXR-beta、MCBF、Myo D、NF-1 (-likeproteins)、NF-AT1、NF-ATc、NF-ATx、NF-CLE0a、NF-CLE0b、NF-E3、NF-kappa B、NHP-1、NIP、p58、Pax-2、Pax-5、Pax-8、PEBP2alpha A1、PPAR-alpha、PR-alpha、PR-beta、RAR-alpha1、RAR-beta、RXR-alpha、RXR-beta、SF-1、SRF、STAT4、T3R-alpha1、T3R-beta1、T3R-beta2、TBP、TFIID、TFII-Ⅰ、TMF、TR2-11、VDR、XBP-1、Xrp FI、YY1。