《表2 6个马铃薯晚疫病抗性性状在不同分析模型和显著水平下的显著关联标记》

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《马铃薯资源晚疫病抗性的全基因组关联分析》

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1:AUDPC＿2015；2:sAUDPC＿2015；3:AUDPC＿2016；4:sAUDPC＿2016；5:AUDPC＿mean；6:sAUDPC＿mean；a:CMLM模型；b:EMMAX模型；c:FASTLMM模型；d:GLM模型；e:MLM模型；显著水平分别为0.1和0.01。

5种模型下对6个性状分析的QQ图结果表明，在所有模型下关联到显著相关的SNP位点都是可靠的（图2是2个性状AUDPC＿mean和s AUDPC＿mean在5种模型下的QQ图）。在5种分析模型下，共关联到与6种晚疫病抗性性状显著相关（显著水平为0.1和0.01）的SNP位点82个（表2和图3）。其中，6个SNP位点分布在3号染色体（图3-A，B）；3个SNP位点分布在4号染色体（图3-A，B）；1个SNP位点分布在5号染色体（图3-B，C）；分别有2个SNP位点分布在6号、7号染色体（图3-A，B，D）；66个SNP位点分布在9号染色体（图3-A～D）；各有1个SNP位点分布在11号和12号染色体（图3-A，B，D）。在82个SNP位点中，20个SNP位点在所有模型分析中，2种显著水平情况下，与所有性状都相关。它们是31，375，673 （第9个）、31，707，832（第23个）、32，382，888 （第25个）、32，973，114 （第35个）、33，118，463 （第36个）、33，145，927 （第38个）、33，148，740 （第39个）、33，156，262 （第40个）、33，211，574 （第43个）、33，244，698 （第48个）、33，283，731 （第49个）、33，283，949 （第50个）、33，451，096 （第53个）、33，480，937 （第55个）、34，959，324 （第62个）、35，060，347 （第66个）、35，065，836 （第67个）、35，123，523 （第72个）、35，212，534 （第77个）、35，256，410 （第80个）。同一性状下，GLM模型分析定位到的SNP位点数目最多，而MLM模型分析定位到的SNP位点数目最少。在GLM模型下分析，显著水平为0.1时定位到与AUDPC＿Mean相关的SNP位点数目（74个）最多（表2）。