《表3 m RNA(前20)差异表达分析》

《表3 m RNA(前20)差异表达分析》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《心肌肥厚模型:内皮素1刺激人诱导的多能干细胞源性心肌细胞lncRNA表达谱及ceRNA网络的生物信息学分析》


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“logFC”为两组表达值间以2为底对数化的变化倍数,“AveExpr”为平均表达量,“B”为贝叶斯检验后得到的标准差的对数化值。

基于2.2的结果构建lnc RNA-mi RNA-m RNA c e R N A网络(图4)。该图中菱形、三角形、椭圆形分别代表lnc RNA,mi RNA,m RNA。上调的A C 0 1 7 0 0 2与9个m i R N A关联密切,包括h s a-m i R-2 7 a-3 p,h s a-m i R-4 2 5-5 p,h s a-m i R-1 3 5 a-5 p,h s ami R-142-3p,hsa-mi R-761,hsa-mi R-3619-5p,hsami R-23b-3p,hsa-mi R-338-3p,hsa-mi R-449c-5p;上调的MIR210HG与10个mi RNA关联密切,包括h s a-m i R-1 3 5 a-5 p,h s a-m i R-2 0 6,h s a-m i R-7 6 1,hsa-m i R-3 6 1 9-5 p,hsa-m i R-2 1 6 b-5 p,hsa-m i R-2 4-3 p,hsa-m i R-2 7 a-3 p,hsa-m i R-4 4 9 c-5 p,hsa-m i R-1 2 5 b-5 p,h s a-m i R-1 2 9-5 p;下调的L I N C 0 0 3 4 2与9个m i R N A关联密切,包括h s a-m i R-1 3 9-5 p,h s ami R-142-3p,hsa-mi R-193a-3p,hsa-mi R-761,hsami R-3619-5p,hsa-mi R-217,hsa-mi R-27a-3p,hsami R-338-3p,hsa-mi R-129-5p(图4)。该网络中靶基因共32个,其中18个上调,包括TPM3,PIM1,A M OT L 2,I N P P 5 F,F S C N 1,K A N K 4,L I TA F,S L C 7 A 1,K C N J 2,G B A 2,E N P E P,B D N F,T N F R S F 2 1,F O S,L I M S 1,S P R Y 4,M Y C,P L A U;1 4个下调,包括S E M A 6 D,A R L 1 5,R P S 6 K A 5,N R 3 C 2,S F R P 1,T G F B R 3,B M F,E Z H 2,M A P 3 K 5,S L C 1 6 A 1,M X I 1,G P A M,ZWINT,BHLHB9。