《表2 NCBI中的PRV毒株信息》

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《2018-2019年四川省伪狂犬病毒的流行病学调查及gC、gE、TK基因遗传进化分析》


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注:-:时间不详.

根据病毒DNA/RNA抽提试剂盒提取PRV基因DNA,利用NCBI的Primerblast (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/)功能区设计针对g C、g E、TK基因的引物,由生工生物工程(上海)股份有限公司合成(表1)。参照2.1的反应体系扩增病毒g C、g E、TK基因的编码区(coding sequence,CDS),将PCR产物通过San Prep柱式DNA胶回收试剂盒回收,并送至北京擎科生物科技有限公司进行测序。利用DNAStar 7.1软件拼接病毒g C、g E、TK基因核苷酸序列并上传至Gen Bank获得相应的登录号(表2)。从Gen Bank数据库下载已公布的PRV毒株序列作为参考序列(表2),最后通过MEGAX软件,建立针对g C、g E、TK基因的遗传进化树。