《表1 AD内嗅皮层各数据集的基本情况》
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《多个GEO芯片联合分析阿尔茨海默病内嗅皮层的关键基因》
从GEO数据库中下载的3个AD相关的内嗅皮层芯片数据集的具体信息见表1。对3个数据集分别进行DEGs筛选,结果显示:GSE48350中有43个DEGs,包括37个上调基因和6个下调基因;GSE26972中有266个DEGs,包括127个上调基因和139个下调基因;GSE118553中有93个DEGs,包括78个上调基因和15个下调基因。对3个数据集的DEGs绘制韦恩图,结果提示三者间未见共同DEGs,说明这3个数据集之间存在异质性,可能是由于发表时间不同、芯片检测水平不一致,故需对GSE48350、GSE26972、GSE-118553数据集的数据进行批次矫正。对合并的数据进行标准化处理后,结果显示有17个DEGs,且均为上调基因(图1)。
图表编号 | XD00209017500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.02.28 |
作者 | 邵康梅、张凡、蔡宏斌、魏海萍、陈圆圆、葛朝明 |
绘制单位 | 兰州大学第二医院神经内科、甘肃省消化系肿瘤重点实验室、兰州大学第二医院神经内科、兰州大学第二医院神经内科、兰州大学第二医院神经内科、兰州大学第二医院神经内科 |
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