《表2 引物配比及各组分添加量(总体积25μL)》

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《多重实时聚合酶链式反应熔解曲线法同步鉴别蓝鳍金枪鱼、裸盖鱼、异鳞蛇鲭》


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选取蓝鳍金枪鱼、裸盖鱼、异鳞蛇鲭的特异性引物,首先优化退火温度、循环数等扩增条件,已往文献报道多重PCR扩增过程中各引物对存在相互竞争的关系,引物浓度对多重real-time PCR能否扩增目标物种起重要作用,在多重PCR体系中调配合适的引物浓度能够有效避免个别物种漏检情况的发生[29],据此设计系列不同浓度梯度的引物组合体系,根据各组合系统所产生的峰图高度调整不同物种引物浓度,以出现平滑、基本等高且特异的峰值图为标准,选定最优组合体系。如表2所示,采用25μL的PCR体系,其中SYBR Green酶体系预混液12.5μL,上下游引物(5μmol/L)各4.2μL(上下游引物为蓝鳍金枪鱼、裸盖鱼、异鳞蛇鲭特异性引物按比例混合组成),模板DNA 2μL,加无菌重蒸水补足至25μL。real-time PCR程序:95℃预变性5 min;95℃变性10 s,58℃退火和延伸共计45 s,重复35个循环;熔解峰图制作:95℃变性1 min,降温至70℃保持1 min,之后均匀速率(0.02℃/s)升温至95℃,并连续采集各温度下的荧光值;然后,60 s内降温至40℃。以温度为横坐标,荧光值对温度的一阶负导数为纵坐标,制作熔解峰值图。