《表2 IGF-1基因SNPs位点的遗传多态性》

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《山羊IGF-1基因的骨骼肌表达特性及其SNPs与生长性状的关联分析》


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χ20.05(df=1)=3.84,χ20.01(df=1)=6.63

序列对比分析表明,福清山羊和努比亚黑山羊的IGF-1基因CDS序列未发生突变,证实该基因外显子序列高度保守;3个SNPs位点上发生了突变,其遗传多态性及遗传结构见表2。除了戴云山羊在SNP-MS位点上为125/125 bp纯合子外,其余品种SNPs位点上均呈不同程度的多态性分布。G等位基因在福清山羊、努比亚黑山羊、简阳大耳羊和戴云山羊4个品种的SNP-g.1617位点上均为优势等位基因,基因频率为0.53~0.80,GG型和AA型纯合子个体明显多于AG型杂合子个体;χ2检验结果表明,4个品种在该位点上均处于Hardy-Weinberg偏态分布;PIC在0.27~0.37之间,属于中度多态;表明该位点选择程度较低。SNP-MS位点上,125 bp等位基因在4个品种中为优势等位基因,基因频率为0.60~1.00;4个品种在该位点上均处于Hardy-Weinberg平衡状态;福清山羊和简阳大耳羊的PIC为0.36,属于中度多态,努比亚黑山羊为0.18,属于低度多态。SNP-I4位点上,4个品种C和G等位基因的基因频率相近,C等位基因的频率为0.37~0.50;努比亚黑山羊和简阳大耳羊在该位点上处于Hardy-Weinberg偏态分布,戴云山羊和福清山羊在该位点上处于Hardy-Weinberg平衡状态;PIC为0.36~0.38,属于中度多态。