《表1 380例病例组与50例对照组各cg位点甲基化水平》

《表1 380例病例组与50例对照组各cg位点甲基化水平》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《利用数据库资料分析DNA甲基化调控AC004540.4表达水平与肝细胞癌预后相关性》


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注:TCGA.癌症基因组图谱数据库;CEO.基因表达公共数据库;Promoter.启动子。

使用AC004540.4启动子区域6个cg位点甲基化水平均值代替基因的甲基化水平。通过Wilcoxon秩和检验发现,在TCGA数据库HCC组织中,AC004540.4启动子区域甲基化水平中位数(四分位间距)为0.412(0.405),高于癌旁组织的0.195(0.165),差异有统计学意义,Z=-5.651,P<0.001。进一步研究发现,cg12492504、cg13268603、cg14592933、cg24755163、cg17035412和cg26526379位点的甲基化水平在HCC组织与癌旁组织之间差异有统计学意义,P<0.001。验证数据集GSE101728芯片结果显示,HCC组织AC004540.4甲基化水平中位数(四分位间距)为0.346(0.358),高于癌旁组织的0.113(0.044),差异有统计学意义,Z=-6.549,P<0.001。同时,cg12492504、cg13268603、cg14592933、cg24755163、cg17035412和cg26526379位点在HCC组织和癌旁组织甲基化水平差异有统计学意义,P<0.001。见表1。