《表2 14种木本植物SKOR蛋白信息》

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《山新杨钾离子通道基因PdbSKOR的克隆与功能分析》

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以拟南芥Ath SKOR（At3g02850）编码序列作为参考序列，在毛果杨基因组数据库中检索到1个同源蛋白SKOR（Potri.017G135400)，下载山新杨SKOR基因的CDS序列并设计上下游引物，提取山新杨组培幼苗整株总RNA，反转录获得第1链c DNA模板，PCR扩增山新杨Pdb SKOR基因的CDS序列，克隆到p MD19-T载体，转化感受态大肠杆菌（Escherichia coli）DH5α，筛选阳性克隆子，送生工生物工程(上海）股份有限公司测序，获得山新杨Pdb SKOR的CDS序列，含有2 526 bp，编码841个氨基酸，提交NCBI数据库获得Gen Bank登录号MT335814 （表2）。利用Pfam在线服务器在Pdb SKOR蛋白中检测到离子通道跨膜域（S1—S6，PF00520）、环核苷酸结合域（c NBD，PF00027）、KHA二聚体结构域（PF11834）和ankyrin锚蛋白域（ANKY，PF12796）等功能结构域（图1），并鉴定了极为保守的通道特征标签序列GYGD，暗示Pdb SKOR是一个典型的K+外排型通道。此外，三级结构预测表明山新杨Pdb SKOR和红皮柳Spu SKOR具有类似的蛋白质高级结构（图2）。