《表1 屎肠球菌CMCC32901菌株的全基因组特征》

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《乳酶生生产用菌种的全基因组序列分析研究》

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应用Solexa测序技术进行全基因组测序分析，共获得4 606 666个读长片段，测序深度达到待测细菌基因组大小的500倍。采用velvet V 1.2.0 3软件对测序数据进行拼装，最终获得40个基因组contig片段，其中最大contig片段为461 121 bp，平均每个contig片段大小为69 064 bp，N50大小为180 554 bp。经拼接比对分析发现屎肠球菌CMCC32901染色体全基因组序列全长为2 394 726 bp（表1），同时通过软件glimmer 3.02进行基因预测，最终在CMCC32901菌株中鉴定出2718个基因，平均长度为881 bp，编码基因占整个基因组序列的86.7%，其平均GC含量为39.1%。基因组中非编码基因间区域大小为367 870 bp，在基因组序列中占比为13.3%，在非编码RNA中鉴定出40个t RNA与3个r RNA序列。