《表1 esp在屎肠球菌、表皮葡萄球菌所编码蛋白的二级结构比较》

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《牛源粪肠球菌esp基因的表达及生物信息学分析》


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应用Predict Protein工具分析及PORTER软件预测esp的二级结构,发现esp二级结构以α-螺旋、无规则卷曲和β-折叠为主,属于混合型蛋白(图3)。同时对esp在表皮葡萄球菌、屎肠球菌中编码蛋白二级结构氨基酸残基进行比较发现,esp在粪肠球菌中的无规则卷曲和β-折叠比在表皮葡萄球菌略多一些(表1)。应用SWISS-M ODEL/SWISS-Pdb View等工具,按照同源建模法构建出esp基因在表皮葡萄球菌、屎肠球菌中所编码蛋白的三级结构具有较大的不同(图4)。