《表2 不同处理组肠道菌群门的水平及其相对丰度百分比》

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《益生菌制剂和抗生素对凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)非特异性免疫及肠道微生物的影响比较》

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通过Mi Seq高通量测序平台对3组样品V3+V4区进行微生物多样性检测，使用97%相似度的OTU，利用mothur做rarefaction分析，由逐渐趋于平稳的稀疏曲线图可见，数据合理可靠（图3）。VENN图（图4）直观的展现出样品OTU数目相似性及重叠情况，对照组、益生菌组和抗生素组共同含有OTU 508个。通过表1中Alpha多样性指数呈现了微生物的丰富度和多样性，益生菌组Simpson指数最低，Shannon指数最高，而Chao1和ACE指数抗生素组最低，益生菌组肠道微生物多样性大于抗生素组和对照组。在门的水平对样品物种丰度进行统计分析，结果显示（表2、图5），益生菌制剂E1组肠道微生物中变形菌门Proteobacteria（69.10%）、放线菌门Actinobacteria（12.62%）、疣微菌门Verrucomicrobia（4.09%）和Candidatus Saccharibacteria（3.01%）丰度增加，而抗生素E2组放线菌门Actinobacteria（5.56%）、Candidatus Saccharibacteria（3.83%）和拟杆菌门Bacteroidetes（2.65%）丰度稍有增加。