《表2 EST序列比对结果》
提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《酵母单杂交文库构建及巨峰葡萄VvFT基因启动子上游调控因子筛选》
对测序获得34条EST序列进行BLASTx比对搜索,筛选出期望值e-10以下的序列进行同源对比,并对其进行功能注释,结果发现21条EST为未知功能序列,其余13条EST被功能注释(表2)。13条EST序列与同源基因表现出较高的相似性,仅ft64序列与同源基因的相似性为93%,其他EST序列与同源基因的相似性均大于95%,尤其是ft15和ft41序列与同源基因的相似性高达100%。13条EST序列中,38.46%与植物生长、抗逆防御、信号转导及转录调控相关,其中ft49(休眠相关蛋白)与植物休眠相关,ft64(NAP1相关蛋白)和ft44(GRF1互作因子3)与植物器官生长发育相关,ft70(分子伴侣Dna J10)与高温胁迫和花芽分化相关,ft41(转录抑制因子ILP1)与基因转录调节相关;38.46%的EST被注释为蛋白酶,包括肽蛋氨酸亚砜还原酶B5(ft15)、角鲨烯环氧酶3(ft19)、S-腺苷甲硫氨酸合成酶(ft42)、氧依赖的粪卟啉原-III氧化酶(ft60)和超氧化物歧化酶(ft68)。
图表编号 | XD00196610300 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2020.12.30 |
作者 | 黄桂媛、张瑛、林玲、韩佳宇、时晓芳、曹雄军、郭荣荣 |
绘制单位 | 广西农业科学院葡萄与葡萄酒研究所、广西农业科学院葡萄与葡萄酒研究所、广西农业科学院葡萄与葡萄酒研究所、广西农业科学院葡萄与葡萄酒研究所、广西农业科学院葡萄与葡萄酒研究所、广西农业科学院葡萄与葡萄酒研究所、广西农业科学院葡萄与葡萄酒研究所 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |