《表4 KEGG通路分类统计》

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《辛硫磷胁迫对异育银鲫细胞基因表达的影响》


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KEGG是一个整合了基因组、化学和系统功能信息的巨大数据库,包括细胞内分子互作网络、信息和特异生物学变化。进行KEGG通路分析可以深入了解基因的生物学功能。辛硫磷处理的Gi CF细胞转录组样品表达基因按照KEGG中通路类型,可以分为6大类:细胞过程(Cellular processes)、环境信息处理(Environmental information processing)、遗传信息处理(Genetic information processing)、人类非病毒感染性疾病(Human diseases)、代谢(Metabolism)、生物体系统(Organismal systems)(注:根据具体物种情况,获得的分类数目不同)。本次测序结果中,信号转导通路上的差异表达基因最多,达6 518个,其次是癌症和免疫系统。差异表达基因大多集中在人类疾病、生物体系统和代谢类的信号通路上(表4)。