《表1 DPO引物序列:一株小球藻伴生菌的分离与鉴定》

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《一株小球藻伴生菌的分离与鉴定》


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小球藻液中分离的菌株经PCR扩增获得碱基长度为1 430 bp的16S r DNA序列。一般而言,归为一个属的序列一致性在95%到99%之间,属于一个种的序列一致性在99%以上。BLASTn分析结果表明,菌株的16S r DNA序列与Microbacterium sp.的序列一致性最高达99%(表1),说明该菌为微杆菌属,它的分类地位为放线菌亚纲(Actinobacteridae)、放线菌目(Actinobacterales)、微球菌亚目(Micrococcineae)、微杆菌科(Microbacteriaceae)、微杆菌属(Microbacterium),将其命名为JGC3。用MEGA7.0对Microbacterium sp.JGC3与其近缘菌构建16S r DNA序列的系统发育树,发现该菌株近缘的菌株均属Microbacterium (图4)。