《表2 TM/PTM中ERDs的SNV发生频率与基因表达的相关性》
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《肝细胞癌模型小鼠中外泌体来源RNA剪接基因的功能及差异表达分析》
SNV和INDEL分析显示,TM与PM对比,差异基因发生了110个SNV和3个INDEL位点的改变;TM与PTM对比,差异基因发生了112个SNV和4个INDEL位点的改变。且两组对比样本的基因位点的改变都主要发生在基因的6个部位,即外显子区(exonic)、内含子区(intronic)、基因间区(intergenic)、基因下游区(downstream)、基因上游区(upstream)和剪接区(splicing)(图4)。在这些核苷酸位点发生改变的基因中,TM与PM对比中有16个RNA剪接相关的差异基因的SNV改变具有统计学意义,其中有12个ERDs的SNV改变与其基因的表达呈正相关(表1)。TM与PTM中有16个差异基因SNV改变有统计学意义,其中11个SNV改变与其基因的表达也呈正相关(表2)。
图表编号 | XD00190876100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.09.28 |
作者 | 阮文慧、唐玉莲、倪安妮、李根亮、李曙波、陆瑞群、黄海玲 |
绘制单位 | 右江民族医学院生物化学与分子生物学教研室、右江民族医学院生物化学与分子生物学教研室、右江民族医学院生物化学与分子生物学教研室、右江民族医学院生物化学与分子生物学教研室、右江民族医学院生物化学与分子生物学教研室、右江民族医学院生物化学与分子生物学教研室、右江民族医学院生物化学与分子生物学教研室 |
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