《表1 SARS-Co V-2中国分型法与三种国际分型法的大体对应关系》
由于科学家们的资源共享与交流学习,在Nextstrain网站上,除了可选择Nextstrain分型法的可视化的系统发育树外,也可以直接定义GISAID分型法与Pangolin分型法的系统发育树(图6)。可以看出三种分型方法的一些异同点:所有的分型方法都是基于SNP C8782T和T28144C定义型别划分大框架之后再根据不同的方法进行细分;中国分型法和GISAID分型法定义为S和L;Pangolin分型法定义为A和B;Nexstrain定义为19B和19A。此外,对于一些大的子分支,三种分型方法划分基本一致。例如近期在世界上大规模流行的毒株,中国分型法划分为L型欧洲家系分支I;Pangolin分型法划分为B.1.1分支;Nextstrain分型法划分为20B簇;GISAID分型法划分为GR簇。此外,此分支的亲本分支划分也基本一致:中国分型法划分为L型欧洲家系;Pangolin分型法划分为B.1分支;Nextstrain分型法划分为20A簇;GISAID分型法划分为G簇[17,19,20]。中国分型法和三类国际通用法对比,也存在很多共同点(表1)。
图表编号 | XD00188495400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.01.01 |
作者 | 宋洋、许文波 |
绘制单位 | 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |