《表1 SARS-Co V-2中国分型法与三种国际分型法的大体对应关系》

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《新型冠状病毒基因组序列的网络平台与基因分型》


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由于科学家们的资源共享与交流学习,在Nextstrain网站上,除了可选择Nextstrain分型法的可视化的系统发育树外,也可以直接定义GISAID分型法与Pangolin分型法的系统发育树(图6)。可以看出三种分型方法的一些异同点:所有的分型方法都是基于SNP C8782T和T28144C定义型别划分大框架之后再根据不同的方法进行细分;中国分型法和GISAID分型法定义为S和L;Pangolin分型法定义为A和B;Nexstrain定义为19B和19A。此外,对于一些大的子分支,三种分型方法划分基本一致。例如近期在世界上大规模流行的毒株,中国分型法划分为L型欧洲家系分支I;Pangolin分型法划分为B.1.1分支;Nextstrain分型法划分为20B簇;GISAID分型法划分为GR簇。此外,此分支的亲本分支划分也基本一致:中国分型法划分为L型欧洲家系;Pangolin分型法划分为B.1分支;Nextstrain分型法划分为20A簇;GISAID分型法划分为G簇[17,19,20]。中国分型法和三类国际通用法对比,也存在很多共同点(表1)。