《表1 肝细胞HBV DNA及ccc DNA定量检测引物列表》

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《肝癌患者血清乙肝病毒e抗原与肝细胞HBV cccDNA水平的相关性》


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注:引物在HBV基因组上定位参考HBV C型标准株序列 (Genebank号:X04615)

使用QIAamp DNA Mini kit(QIAGEN,德国)提取血清及组织HBV DNA,使用ABI 7500荧光定量PCR仪(Life Technologies Corporation,美国)检测血清HBV DNA及组织ccc DNA。定量检测方法参考文献[12],使用质粒安全ATP依赖的NDA酶处理肝细胞总DNA,获得HBV DNA及ccc DNA,使用Taqman荧光探针PCR法检测HBV DNA及HBV ccc DNA,使用引物F1和R1,Taq Man探针P1,对组织HBV ccc DNA进行定量,使用引物F2和R2,Taq Man探针P2对组织HBV DNA进行定量。组织内HBV DNA和ccc DNA定量均参考组织甘油醛3-磷酸脱氢酶(glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase,GADPH)定量进行标准化[13],各引物序列详见表1。