《表1 88株沙雷菌CRISPR-Cas系统分布》

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《沙雷菌CRISPR-Cas系统的基因结构分析》


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纳入分析的沙雷菌共计88株涵盖10余种,其中76株有完整的基因组结构信息,12株基因组信息虽然不完整但其染色体核酸序列连续且基因注释完善。结果显示有43株沙雷菌(48.86%)含有CRISPR阵列,其中19株(21.59%)含有确定CRISPR阵列(confirmed CRISPR array),13株同时含可疑CRISPR阵列(questionable CRISPR array),24株仅含可疑CRISPR阵列。其余45株沙雷菌(51.14%)无确定CRISPR或可疑CRISPR。确定CRISPR阵列仅存在于细菌染色质上,共计39个,大多数菌株含1~2个确定阵列;可疑CRISPR阵列既有位于染色体的也有位于质粒的,共计59个。在所分析的确定CRISPR阵列中,部分菌株的CRISPR阵列完全或部分相同(表1)。