《表5 测序序列分类地位及相似性比对Table 5 Taxonomic affiliation of sequenced DGGE bands and their best matches in th

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《电子垃圾拆解区农田土壤微生物群落结构研究》


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对DGGE图谱中11个条带(见图2)进行割胶回收测序,所得序列在核糖体数据库(http://rdp.cme.msu.edu/)中获得序列所代表微生物的分类地位,并在Gen Bank数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)中进行BLAST分析,确定亲缘关系较近的物种,结果如表5所示。在所得11个克隆序列中,有3条序列属于变形菌门(Proteobacteria),占总克隆数的27.3%,其中Beta-、Alpha-和Gamma-Proteobaeteria纲各有1条。其它序列分属于放线菌门Actinobacteria(2条,18.2%)、绿弯菌门Chloroflexi(2条,18.2%)、拟杆菌门Bacteroidetes(2条,18.2%)、Ignavibacteriae门(1条,9.1%)和硝化螺旋菌门Nitrospirae(1条,9.1%)。从分离到克隆的所在门(纲)水平来看,其分布较广,并未仅集中于某几类微生物类群,说明拆解区土壤微生物较为丰富。2、4和7号条带在焚烧迹地和农田土壤中均有出现,说明Proteobacteria和Bacteroidetes是清远电子垃圾拆解区土壤主要细菌类别,此2类微生物在受不当电子垃圾拆解污染的土壤微生物群落中具有重要的地位。