《表2 野生和圈养繁殖群不同肠段微生物α多样性指数的比较》
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《野生树鼩与人工饲养树鼩消化道不同部位微生物组成的比较研究》
注:不同肠道间比较,*0.01
在检查了测序的质量后,从42个不同胃肠道样本中获得了2305843个有效序列。通过不同样品在97%一致性阈值下的α多样性指数(shannon、simpson、chao1、ACE、goods_coverage)分别对样本序列进行丰富度和多样性分析。结果显示覆盖范围从99.1%到99.7%,表明本实验每个样品的丰富度及多样性足以完整描述该样品菌群的组成;Shannon指数及Chao 1指数结果显示,野生组树鼩空肠和胃低于人工繁育组,其余肠段均高于人工繁育组,说明以上野生树鼩大部分肠段内菌群多样性高于人工繁育树鼩,且Shannon指数显示,野生组胃内菌群多样性与人工繁育组差异极显著(P<0.01),而盲肠内菌群多样性野生组明显高于人工繁育组(P<0.05)(见表2)。同时,从表2可以看出野生树鼩各肠段OTUs数从高到低依次是:十二指肠、结肠、回肠、直肠、空肠、盲肠、胃;而人工繁育组依次是:空肠、胃、直肠、回肠、结肠、盲肠、十二指肠。
图表编号 | XD00178839600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.30 |
作者 | 李艳艳、杨凤梅、王俊斌、陈丽雄、段素琴、杨亚平、刘雨、和占龙、马进、赵远 |
绘制单位 | 中国医学科学院、北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室、中国医学科学院、北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室、中国医学科学院、北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室、中国医学科学院、北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室、中国医学科学院、北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室、中国医学科学院、北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室、中国医学科学院、北 |
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