《表5 雏鸡盲肠微生物物种丰富度及α＿多样性指数的比较》

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《高钙高蛋白日粮对肉仔鸡生长性能、血清生理生化指标和盲肠菌群的影响》

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本研究对12份雏鸡盲肠内容物样品进行了Illumina Miseq高通量测序，共得到有效序列587 884条。在97%的相似水平下对序列进行OTU的聚类，统计得到所有样品在不同OTUs中的丰度信息，共产生15 260个OTU。对于菌群而言，Alpha多样性代表每个样品中菌群的多样性，通过多种指数可以反映样品中菌群的多样性。Simpson指数和Shannon指数来估算样品中微生物多样性，其中Shannon值越大，说明群落多样性越高；Simpson指数越大，说明群落多样性越低。从表5可以看出，高蛋白组的物种丰富度极显著高于对照组、高钙组、高钙高蛋白组（P<0.01）；高钙高蛋白组的Shannon值显著低于对照组（P<0.05），其他3组Shannon值相近；各组Simpson无显著差异。