《表1.CPR细菌已知门水平成员信息》

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《候选门级辐射类群(CPR)细菌研究进展》


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CPR细菌广泛存在于地下水、沉积物、含水层、动物口腔等生境中(表1)。OP11(小基因组菌超门,Microgenomates)被Hugenholtz等第一次发现时,其并不仅仅存在于热泉水体中,在其他淡水和沉积物样品中也可以被检测到[23–24]。WS6分支在地表污染水体中被发现,而且WS6分支的16S rDNA变异程度明显高于其他已知的细菌门,反映同一环境中存在多种不同的WS6分支微生括胃肠道、皮肤和生殖道)中被报道[21–22,38–39]。在研究不同地下水深度CPR细菌丰度时,发现其在表层、中间层和深层都有分布,其中中间层的丰度最高[31]。Herrmann等比较土壤和淡水中的CPR细菌,发现其在水体中的相对丰度明显高于土壤,而且网络分析的结果表明部分CPR细菌的丰度与水体营养盐指标呈现负相关关系,说明CPR细菌适应寡营养环境[40]。深水湖底层类似于深海水体,营养物质极少,Cabello等在贝尔加湖底层水体中也能组装获得CPR MAGs,同样反映CPR细菌可以生活在寡营养环境中[41]。综上所述,绝大部分已发现的CPR细菌来源于地下水体、热泉、沉积物等寡营养生境,而且自然丰度不低(表1)。