《表2.江苏、安徽和浙江三省样品PCV2检测结果》

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《2010–2015年华东地区猪圆环病毒2型的分子流行病学分析》

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为了解我国华东部分地区PCV2的基因多样性、遗传变异和进化规律，本文将测得的42株全基因组序列与GenBank中的11株参考毒株序列进行同源性和遗传进化分析。结果表明，53株PCV2序列的核苷酸同源性为93.6%–100.0%，201205AH株与EU148505 DK1990PMWSfree PCV2c株亲缘关系较远，只有93.6%。53株PCV2中有2株为PCV2c基因型（3.77%），10株为PCV2b基因型（18.87%），9株为PCV2a基因型（16.98%），32株为PCV2d基因型（60.38%）（图1）。本文测得的42株华东地区PCV2流行株间核苷酸序列同源性为94.0%至100.0%，隶属于PCV2a亚型的20150423YR株与隶属于PCV2d亚型的201112ZJ的差异最大，序列同源性仅有94%。本研究获得的42株PCV2序列，6株为PCV2a基因型（14.29%），7株为PCV2b基因型（16.67%），29株为PCV2d基因型（69.05%），未发现PCV2c基因型。这些结果表明各测序毒株与参考毒株间的同源性均较高，PCV2d为华东地区的优势基因型。尽管本研究未在浙江和安徽发现PCV2b的存在，但由于测得序列数量有限，尚不能判定基因型与区域性分布之间的规律。