《表4 Hsa-mi R-411-3P靶基因的GO生物学过程分析》

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《Hsa-miR-411-3P对胃癌细胞作用功能及相关分子机制的研究》


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对235个交集靶基因进行GO分析,分子功能集中在酶结合、蛋白质结合、转移酶活性等(表3);生物学过程集中在代谢过程、细胞组件组装、解剖结构发展、细胞成分生物发生等(表4)。对235个交集靶基因进行KEGG分析,KEGG信号通路集中在胰岛素信号通路、c AMP信号通路、AMPK信号通路、FOXO信号通路等(表5)。胰岛素信号通路、AMPK信号通路、FOXO信号通路、c AMP信号通路都与胃癌密切相关[4-8]。其中,c AMP信号通路有4个与胃癌相关性较高[9-15]、表达量较大(图4)、差异较显著(筛选标准:FDR<0.05且|log2FC|>1)的Hsa-mi R-4 1 1-3 P靶基因VAV 3、ROCK2、PLD1、PTCH1共同参与。这4个基因可能与Hsa-mi R-411-3P存在负调控关系,因为在测序结果中,黄连素处理SGC-7901细胞后Hsa-mi R-411-3P表达(tags per million,TPM)上调,靶基因VAV3、ROCK2、PLD1、PTCH1(fragments per kilobase of transcript per million mapped reads,FPKM)表达下调(图4)。