《表1 New PLACE预测JrERF2-2启动子顺式作用元件--》
以JrERF2-2基因在NCBI数据库中进行BLASTX搜索,发现JrERF2-2基因与核桃的一条ERF序列(XP_018835823.1)一致。因此,以XP_018835823.1起始密码子上游1 455 bp的DNA序列作为JrERF2-2启动子,并对其进行顺式作用元件分析。结果发现,该启动子中含有多种与逆境响应相关顺式作用元件,如干旱早期响应元件(ACG-TATERD1)、热激蛋白与热胁迫响应元件(CCAAT-BOX1)、低温响应元件(LTRE1HVBLT49);存在许多激素响应相关元件,赤霉素调控元件(CAREOS-REP1)等;同时,也存在诸多转录因子识别元件,如Dof、MYB等(表1)。
图表编号 | XD00167332600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.05.01 |
作者 | 刘玉梅、赵焕元、崔茂凯、王田雨、高向倩、杨桂燕 |
绘制单位 | 西北农林科技大学林学院山阳核桃试验示范站、西北农林科技大学林学院山阳核桃试验示范站、西北农林科技大学林学院山阳核桃试验示范站、西北农林科技大学林学院山阳核桃试验示范站、西北农林科技大学林学院山阳核桃试验示范站、西北农林科技大学林学院山阳核桃试验示范站、西北农林科技大学林学院陕西省经济植物资源开发利用重点实验室 |
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