《表2 核心靶点及拓扑学参数》
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《基于网络药理学的人参、黄连“药对”治疗2型糖尿病作用机制研究》
将人参、黄连治疗T2DM的41个关键靶点导入String数据库获取蛋白相互作用关系,再导入Cytoscape软件绘制蛋白关系网络。见图2。该网络图共包括42个节点,229个边。以连接度(Degree)数值反映节点的大小,Degree指与该节点相关联边的条数。Degree数值越大,节点越大,表明这些靶点参与可更多的生物功能,在网络中具有重要地位。其中Degree值前五名的靶点有CYP3A4、CYP2B6、CYP2C9、TNF、VEGFA。为了进一步筛选出具有拓扑重要性的主要节点,计算了网络中每个节点的3个拓扑特征:Degree、介度(Betweenness)和紧密度(Closeness)。Degree、Betweenness和Closeness的中值分别为12、0.017和0.516。确定Degree>12、Betweenness>0.017和Closeness>0.516的节点为主要节点,这些节点可能在人参、黄连“药对”治疗T2DM中具有重要意义,共筛选出25个主要靶点,以这些节点构建基因调控蛋白相互作用网络(PPI),并对网络进行生物过程、分子功能和通路富集分析。见表2。
图表编号 | XD00161177400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.06 |
作者 | 孙瑞茜、傅强、赵进喜 |
绘制单位 | 北京中医药大学东直门医院肾病内分泌科、北京中医药大学东直门医院肾病内分泌科、北京中医药大学东直门医院肾病内分泌科 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |