《表2 5个核心子网络体系所涉核心度排名前10的靶点》
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《利用网络药理学方法探讨针对新型冠状病毒肺炎以ACE2为治疗靶点的5味中药的作用机制和组分配伍》
为了能够系统性地揭示上述5种中药的药理作用机制,进一步构建了PPI网络体系。首先使用STRING蛋白-蛋白互作在线预测数据库,分别将上述5种中药对应的潜在药物治疗靶点依次输入并进行分析,置信度分值设置为0.700,待生成tsv格式结果后,将其导入CytoScape 3.2.1完成结果可视化,具体结果见表1。考虑到上述5种中药对应的潜在药物靶点在PPI网络体系中的数量及关系较为复杂,因此继续使用Cytoscape 3.2.1软件中的MCODE插件进行复杂PPI网络体系的核心子网络提取处理,将选择出分值排名最高的5个核心子网络用于后续的功能及通路富集分析,5味中药PPI网络体系的拓扑学参数见表1。与此同时,每个核心子网络中按照所处体系核心度排名前10位的靶点结果见表2、图2。
图表编号 | XD00159187200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.09.28 |
作者 | 王耘、潘博宇、房森彪、张炬、潘战宇、刘立仁 |
绘制单位 | 天津医科大学肿瘤医院中西医结合科国家肿瘤临床医学研究中心天津市“肿瘤防治”重点实验室天津市恶性肿瘤临床医学研究中心、胃肠肿瘤生物学研究室天津医科大学肿瘤医院国家肿瘤临床医学研究中心天津市“肿瘤防治”重点实验室天津市恶性肿瘤临床医学研究中心、中南大学计算机学院、武汉研锦生物科技有限公司华中农业大学悦创中心、天津医科大学肿瘤医院中西医结合科国家肿瘤临床医学研究中心天津市“肿瘤防治”重点实验室天津市恶性肿瘤临床医学研究中心、胃肠肿瘤生物学研究室天津医科大学肿瘤医院国家肿瘤临床医学研究中心天津市“肿瘤防治”重点实 |
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