《表3 石榴SUT家族基因启动子及其核苷酸组成》

《表3 石榴SUT家族基因启动子及其核苷酸组成》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《石榴SUT基因家族鉴定及其在籽粒发育过程中的表达分析》


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通过比对分析,在‘突尼斯’石榴基因组数据库中共获取到SUT基因家族的10个成员,分布在Chr1、Chr3、Chr4、Chr5、Chr6和Chr7上(表2)。其中,Chr3和Chr6含有的SUT基因家族成员数量最多,均为3个。结果分析表明物种内不同SUT基因的长度变化较大,石榴SUT基因序列的平均长度为4 406.7 bp。石榴SUT家族基因最长与最短序列相差7 735 bp。石榴SUT基因腺嘌呤、胞嘧啶、鸟嘌呤及胸腺嘧啶的平均含量分别为28.50%、21.57%、22.77%和27.14%。GC平均含量为44.35%,与石榴基因组GC含量相当。启动子序列腺嘌呤及胸腺嘧啶的平均含量高于基因序列,分别为30.51%和30.71%(表3)。然而,启动子区序列的胞嘧啶、鸟嘌呤及GC平均含量均低于基因组序列,分别为19.17%、19.62%和38.79%(表3)。相关分析表明石榴SUT基因长度与其GC含量显著相关(p<0.01),相关系数为0.87。