《表1'Liyu B',CH7,CH8和CH9重测序数据统计》

《表1'Liyu B',CH7,CH8和CH9重测序数据统计》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《水稻杂种劣势相关亲本的全基因组重测序及其遗传变异分析》


  1. 获取 高清版本忘记账户?点击这里登录
  1. 下载图表忘记账户?点击这里登录

对杂种劣势相关的3个亲本品种CH7、CH8和CH9以及1个对照品种‘Liyu B’进行全基因组重测序。‘Liyu B’总共获得138 104 722个有效测序数据,CH7、CH8和CH9分别获得129 994 250个、149 107 224个和131 824 382个有效测序数据(表1)。过滤除掉带接头或低质量的Reads或有引物污染的Reads,‘Liyu B’获得的高质量Clean Reads比例为95.58%,高质量(≥Q30)碱基占比为93.98%;CH7、CH8和CH9的高质量Clean Reads分别占比为95.23%、95.67%和94.76%,高质量碱基(≥Q30)占比分别为93.82%、94.06%和93.88%。将高质量Clean Reads回贴到参考基因组上,‘Liyu B’获得了98 331 157个Mapped Reads,高质量Mapped Reads占比为89.98%;CH7、CH8和CH9分别获得了高质量Mapped Reads为91 629 027个、104 176 261个和92 261 940个,高质量Mapped Reads占比分别为89.83%、88.84%和89.71%。