《表3 乳腺癌亚型的药物推荐》
对于乳腺癌亚型患者的精准用药是有效治疗乳腺癌的一大难题,实现合理的乳腺癌亚型药物推荐具有重要临床意义。基于本文所提方法,首先从Drug Bank数据库网站(https://www.drugbank.ca/)[18]下载了与乳腺癌相关的药物和药物对应的靶基因数据。然后,分别选择正常型与其它乳腺癌亚型间JS散度大于0.3的基因并作集合得到129个差异可变剪接基因。本文将靶基因和这129个基因作交集,发现8个公共基因。如表3所示,展示了基于这8个基因相应的药物推荐和这些基因在不同乳腺癌亚型中与正常型之间JS散度。由表3可知,这8个基因均在Basal型乳腺癌患中发生的可变剪接紊乱程度较大,所以可推荐的药物种类较多。主要是因为Basal型乳腺癌侵袭性较强,死亡率相对较高,使得Basal型乳腺癌成为主要研究对象。对于LumA型乳腺癌,发生可变剪接紊乱的基因最少,适合推荐的药物有Enzastaurin[19],AT9283[20]。同样在现实中,LumA型乳腺癌的预后效果在乳腺癌中是最好的,一般仅需针对内分泌的治疗即可,所以可变剪接紊乱的基因相对较少。因此,可以根据基因的可变剪接紊乱程度为患者找寻重要的癌症亚型标志物,为患者提供个性化乳腺癌亚型药物推荐。
图表编号 | XD00151367100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.01 |
作者 | 许鹏、王兵、方刚、石晓龙、刘文斌 |
绘制单位 | 广州大学计算科技研究院、黔南民族师范学院计算机与信息学院、温州大学计算机与人工智能学院、广州大学计算科技研究院、广州大学计算科技研究院、广州大学计算科技研究院、温州大学计算机与人工智能学院 |
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