《表1 水鬼蕉生物碱类化合物》

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《水鬼蕉生物碱类化合物抗肿瘤分子对接研究》

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以“水鬼蕉”作为关键词，从TCMSP数据库中搜索生物碱类化学成分，从Pubchem、SciFinder数据库下载相应化合物结构及文献（表1），用Chem3D转为mol2格式，建立配体小分子化合物库。所有配体小分子均采用分子程序MM2的Minimize energy模块进行结构优化，得到的稳定优势构象保存为mol2格式。使用Openbabel软件批量处理mol2格式的小分子，转换为pdbqt格式保存。