《表5 14个SSR标记的PE值》

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《浙江开化县茶树种质资源的遗传多样性及亲缘关系分析》


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利用GenAlEx软件,将基因分型数据进行复合位点分析。结果发现,基于14个SSR标记组合,36份供试样本的数字化基因分型如图2所示。本试验的14个SSR标记鉴别结果显示,编号17和18的两个样本具有相同的基因型,因此我们推测这两个样本的遗传背景相同。此外,我们进一步计算了复合位点的非同一概率值PE(表5)。PE-1表示位点未缺失时的PE值,PE-2表示缺失1个位点的PE值,PE-3表示去除1个纯合位点的PE值。由表5可知,14个SSR位点的PE-1值的范围在0.212 1~0.588 8,均值为0.403 3;PE-2值的范围在0.079 1~0.409 8,均值为0.244 0;PE-3值的范围在0.352 7~0.771 3,均值为0.569 5;在位点未缺失的情况下,14个SSR位点组合后,两个随机样本基因型组合不同的概率值(PE-1)为0.999 4;若缺失一个位点时,14个SSR位点组合后两个随机样本基因型组合不同的概率(PE-2)为0.981 5;在去除一个纯合位点的情况下,14个SSR位点组合后两个随机样本基因型组合不同的概率(PE-3)为1.000 0。