《表1 基于5株茶树的30个SSR标记的多态性参数》
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《基于SSR标记的古茶树(Camellia sinensis)遗传关系分析》
注:NA:等位片段数;ASR:等位片段范围;MAF:主等位片段频率;HO:观测杂合度;%PIC:多态性信息量;-:没有数值
本研究所用的分子标记与用于128个茶树品种指纹构建的30个SSR相同(Tan et al.,2015)。通过对4株古茶树(YL01,YL02,YL03和YL04)和1个铁观音品种‘Tieguanyin2’进行PCR扩增,并利用荧光dUTP法进行SSR分型检测(图1)(显示了2个标记的分型结果),30个标记共检测到等位片段(number of alleles,NA)124个,每个标记的等位片段数为1~9个,平均为4.1个;位点CsFM1504只有1条等位片段,CsFM1068的等位片段数最多、为9个;等位片段范围(allele size range,ASR)为93 bp~378 bp;主等位片段频率(major allele frequency,MAF)0.300~1.000,平均为0.507;观测杂合度(observed heterozygosity,HO)平均值为0.660,变化范围为0~1;多态性信息量(polymorphism information content,PIC)从0到0.868不等,平均值为0.558(表1),表明这些标记多态性较高、具有较强的品种鉴别能力。
图表编号 | XD00152936300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.07.14 |
作者 | 周长品、甘四明、李发根、翁启杰、张照远、马锦林 |
绘制单位 | 中国林业科学研究院热带林业研究所热带林业研究国家林业局重点实验室、中国林业科学研究院热带林业研究所热带林业研究国家林业局重点实验室、中国林业科学研究院热带林业研究所热带林业研究国家林业局重点实验室、中国林业科学研究院热带林业研究所热带林业研究国家林业局重点实验室、广西壮族自治区林业科学研究院广西特色经济林培育与利用重点实验室、广西壮族自治区林业科学研究院广西特色经济林培育与利用重点实验室 |
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