《表2 随机选取的序列数目、落入d取值区间的数目及被预测为CDSs的概率》
为检验d值否可以用来区分CDSs序列,对d值用于预测的效率进行研究。随机取若干条CDS序列、外显子、内含子、5′-UTR、3′-UTR和RS,将它们均假定为CDSs来计算它们相应的d值,并依此来推测它们为潜在CDSs(或ORFs及它的子片段)的可能性:若某一片段的ln(d+D0)值落在上述目标区间内,则该片段被预测为CDS(或ORFs及它的子片段),否则即被认定为非编码序列。结果显示有81.6%的CDSs被判定为CDSs,有70.7%的外显子被认定为CDSs(或ORFs及它的子片段),另有21.8%的内含子、17.8%的5′-UTRs、31.4%的3′-UTRs以及4.7%的RSs被误判为CDSs(或ORFs及它的子片段)(表2)。可以看出,CDSs出现误判的概率最低。以上结果表明:参数d可以作为一个有效区分CDSs(或ORFs及它的子片段,如外显子)和非编码区的特征参数,用于CDSs(或ORFs及它的子片段)的初步预测。
图表编号 | XD00147072700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.05.25 |
作者 | 李勃、方斌、陶靖心、刘明伟 |
绘制单位 | 重庆师范大学生命科学学院、武汉生物制品研究所有限责任公司、重庆师范大学生命科学学院、重庆医科大学检验医学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |