《表3 CDM和CK中的差异表达基因》

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在CK和CDM中过滤掉表达量≤0.5的基因后，筛选出共有43 881个DEGs（图2A）。对于CDM而言，结果显示其上下调的基因分别为23 388个和20 493个（表3）。通过以混合动态剪切为标准的方法建立DEGs的共表达网络（图2B），并以此来划分模块，计算模块特征值（Eigengenes expression）。以相关距离远近为划分标准经过合并后最终得到16个模块（图3）。通过基因与性状关联分析确定棕褐色（Tan）模块中基因表达量与CDM和CK的表型相关性最高（图2C）。此模块中仅在CK表达的基因有74个且包含2个转录因子（transcription factor，TF），仅在CDM表达的基因有12个，二者皆有表达的基因中361个表达上调且包含20个TFs，566个表达下调且包含14个TFs（图2D）。