《表4 基于欧氏距离的18物种相似性矩阵Tab.4 The similarity matrix of 18 species based on the Euclidean distances》

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《基于碱基组成和分布的DNA序列特征提取方法及应用》

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依据数据集（2）的物种相似性矩阵（见表4）构建了图2所示的系统发生树。该进化树主要由两大分支构成:七种灵长类动物完全聚在一起，构成第一大分支，且两种类人猿关系最紧密；除了非卵胎生哺乳动物鸭嘴兽（Platypus）外，其它剩余物种构成第二大分支。鸭嘴兽明显地区别于其它动物，分布在进化树的最外围。在第二大分支中，啮齿类动物和有蹄类动物分别在两个分支上聚成集群，在各自的集群中还有细分的小群，例如有奇蹄目的动物和偶蹄目的动物，陆生动物和水生动物。以上结论与一些已知结果具有较好的一致性[17，31-34]，与物种的进化事实基本相符。