《表2.小RNA测序结果汇总》
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《Emaravirus属新病毒:中国枣树花叶伴随病毒全基因组测序》
通过RNAseq对该枣树病毒的全基因组序列迚行测定和拼接(图2)。CDMa V基因组共含有5条RNA,其中RNA1全长7160 nt,编码271 k Da的Rd Rp,其核酸序列与RLBV的RNA1同源性为83%;RNA2–RNA5全长分别为2224、1230、1493、971 nt,与RLBV相应基因组RNA的核酸序列同源性分别为65%、54%、69%和22%[6,11],依次编码75.9 k Da的包膜糖蛋白、33.1 k Da的核衣壳蛋白以及两个大小分别为42.5 k Da和33 k Da的未知功能蛋白。CDMa V与RLBV具有最高的序列同源性,但基因组比RLBV少3条RNA。CDMa V的所有5条RNA在首尾两端含有约15个核苷酸的反向互补区域,与Emaravirus属的其他成员的特征吻合[1,6]。
图表编号 | XD00139907000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.02.04 |
作者 | 刘达、白剑宇、方荣祥、张莉莉 |
绘制单位 | 中国科学院微生物研究所植物基因组学国家重点实验室、中国科学院大学、新疆林业科学院经济林研究所、中国科学院微生物研究所植物基因组学国家重点实验室、中国科学院大学、中国科学院微生物研究所植物基因组学国家重点实验室 |
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