《表4 紫花报春苣苔离子转运相关的差异表达基因》

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《紫花报春苣苔差异表达基因分析及离子转运蛋白基因挖掘》

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注:*:该差异表达基因|log2Foldchange|≥2，差异显著

在栽培条件一致的情况下，石灰土及红壤的差异使在这两种土壤中栽培的紫花报春苣苔的叶片形态及叶片中某些元素含量存在差别，而不同条件下紫花报春苣苔的离子转运蛋白基因的表达是造成这种差异的重要原因之一。为了搜寻紫花报春苣苔的离子转运蛋白的相关基因，对差异表达基因进行功能注释，参考相关的数据库及文献资料，找到了在紫花报春苣苔中与离子转运有关的差异表达基因共18个（表4），所占比例约为差异表达基因总数的3%。根据离子转运蛋白的功能特性，将18个离子转运蛋白划分为11个不同的类别，主要有大量元素转运蛋白（N，P，K，Ca，S），微量元素转运蛋白（Cu），跨膜蛋白，水通道蛋白，ABC转运蛋白，机械敏感离子通道蛋白及环核苷酸门控离子通道，其中与大量元素转运有关蛋白的差异表达基因数量较多。以石灰土中紫花报春苣苔叶片Unigene表达量作为参照进行比较，虽然差异表达基因中上调表达的基因数量与下调表达的基因数量基本相同，但在红壤中紫花报春苣苔与离子转运蛋白功能相关的大部分差异表达基因的转录模式为下调表达，下调表达基因的比例约占离子转运差异表达基因总数的72%，且所有差异显著的基因（|log2Foldchange|≥2）也都是下调表达。