《表1 引物信息:巴什拜羊miR-486多态性及其表达规律研究》

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《巴什拜羊miR-486多态性及其表达规律研究》


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引物miR-486RTP带下划线的碱基为与bta-miR-486序列3'端互补的8个碱基;引物miR-486qR带下划线的碱基为bta-miR-486序列5'端互补的14个碱基;引物pre-miR-486EF和pre-miR-486ER带下划线的碱基表示酶切位点和保护碱基,斜体碱基表示限制性内切酶HindⅢ和Eco RⅠ的切割位点

检索miRBase数据库(www.mirbase.org),根据其收录的bta-miR-486序列(登录号:MI-MAT0009329)设计stem-loop qRT-PCR引物(表1),巴什拜羊miR-486的组织表达情况以骨骼肌中的表达量为对照,不同发育阶段骨骼肌中的表达情况以出生后90 d骨骼肌中miR-486的表达量为对照,对其组织表达和骨骼肌中时序表达情况进行相对定量。以空白对照细胞中miR-486表达量为对照,对转染突变型和野生型表达载体细胞中miR-486的表达情况进行相对定量。以U6基因(GenBank No.114110180)作为内参基因,结果采用2-ΔΔCt法计算,每个实验重复3次,并计算平均数及标准差。qRT-PCR反应采用20 uL体系:TB Green Premix Ex TaqⅡ(Tli RNaseH Plus)(2×)(TAKARA,大连)10μL,上、下游引物(10μmol/L)各0.8μL,cDNA模板2μL,ddH2O 6.4μL。扩增条件:95℃预变性30 s;95℃10 s,58℃20 s,72℃20 s,40个循环。扩增反应结束后以0.1℃/s的速度进行熔解曲线分析。所有引物由生工生物工程(上海)有限公司合成。