《表4 不同C值下5种印迹类型的iQTL定位结果》

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《基于自然群体随机交配的单个印迹QTL定位的初步研究》

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注：表中括号内为标准差，此处列出C=2、6，交配轮数为7次的结果，表中H代表遗传率，H代表遗传率（Heritability)，C代表C值（C value)，RV代表真值（Real value)，P代表统计功效（Power），POS代表iQTL在染色体上的位置（iQTL position）。

假定一个位于470 kb位置的这个SNP与某个表型性状关联，群体均值为μ=10。模拟前，先计算该位点的SNP频率p和q，印迹效应根据公式12进行推算（C值取2，4，6三种组合）。根据表2中的5种印迹类型得出a，d的值，根据前面的模拟结果，iQTL的遗传力水平设置为10%和15%，利用自然群体进行3、5、7次随机交配，产生随机交配群体。每种模拟情况重复100次，100次参数估计的标准误偏差提供了参数估计误差标准，阈值可用Bonferroni校正，显著性水平为0.05。此处，限于篇幅，仅列出C值取2、6，交配轮数为7次的结果，见表4，交配以后得到的随机交配群体中470 kb处的SNP的频率p为0.54，则q为0.46，接近于1∶1。由于在模拟时选择的i QTL位置上的MAF接近于0.5，从真实数据的模拟结果来看：当遗传率为10%、15%时，5种类型的iQTL定位都具有较好的结果，i QTL所在位置的估计较为准确，各参数估计的准确度和精度达到较好的效果，而且检测功效也较高，在15%时所有类型的i QTL检测功效均为100%。结果表明，随着交配次数的增加，参数估计的精度也得到提高，这符合我们的构想，当样本量增加时，其估计的准确度和精度得到提高；对于常数C值，从表可以看出，随着C值的增加，其参数估计的精度逐渐下降，其原因还有待于进一步研究；从5种类型的印迹QTL来看，在相同的条件下，DIB的检测功效较差，而其余4种DIPOD，DIPUD，PEM，PEP检测的功效相近，由此可见：加性效应和显性效应对iQTL的检测具有一定的影响。