《表1 常用的生物图像数据集》

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《基于模式识别的生物医学图像处理研究现状》


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目前研究中常用的荧光图像数据集主要是出芽酵母、人体、仓鼠等细胞系的荧光显微图像,类型广泛(表1)。细胞图像库Cell Image Library已收集了很多个高质量的细胞图像和视频数据集,如人体U2OS细胞系荧光图像、神经细胞荧光图像等,供研究及教学使用。此外,CYCLoPs数据集对多个酵母细胞系的蛋白图像和标注做了整合[23],包含约3×105幅由荧光蛋白标记的显微图像,并标注了细胞层面上蛋白质的亚细胞位置及在药品处理后的表达量变化。人类蛋白图库(Human Protein Atlas,HPA,http://proteinatlas.org/)存储了约17000种蛋白在20余个细胞系中的约1×105幅免疫荧光图像(ImmunoFluorescence,IF),并由专家标注了蛋白表达水平、亚细胞位置及可信度等,这些图像集为自动化的分析研究提供了有力的数据保障。