《表4 7个与HNSCC总体生存率相关的hub基因的KEGG通路富集分析(P<0.01)》
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《基于生物信息学方法鉴定头颈部鳞状细胞癌的关键基因及信号通路》
为了评估hub在HNSCC中表达的意义,本研究将hub基因导入GEPIA在线分析,结果显示PLAUR(P=0.0092)、ITGA5(P=0.0024)、LAMB3(P=0.011)、LAMC2(P=0.013)、SERPINE1(P=0.0025)、ITGA6(P=0.036)、ITGA3(P=0.045)的差异性表达与HNSCC总体生存率相关(P<0.05)(图7)。与正常头颈部组织相比,上述基因在HNSCC中表达上调(P<0.01)(图8),这一结果与基于GEO数据库的差异分析结果一致。为了初步探索上述基因的作用机制,我们将其导入DAVID V6.8进行通路富集分析,结果显示这7个与HNSCC总体生存率相关的hub基因在多条信号通路上富集,表4列出富集最显著(富集基因数目最多且P值最小)的前3条信号通路。
图表编号 | XD00113010900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.10.18 |
作者 | 张从红、冯华君、周春玲、王丁婷、赵飞鹏、赵冲、许胜恩、覃纲 |
绘制单位 | 西南医科大学附属医院耳鼻咽喉头颈外科、西南医科大学附属医院耳鼻咽喉头颈外科、西南医科大学附属医院耳鼻咽喉头颈外科、西南医科大学附属医院耳鼻咽喉头颈外科、西南医科大学附属医院耳鼻咽喉头颈外科、西南医科大学附属医院耳鼻咽喉头颈外科、西南医科大学附属医院耳鼻咽喉头颈外科、西南医科大学附属医院耳鼻咽喉头颈外科 |
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