《表2 GO富集分析：基于R语言的前列腺癌样本的关键基因数据挖掘》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《基于R语言的前列腺癌样本的关键基因数据挖掘》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

将得到的41个基因利用超几何分布原理在KEGG和GO数据库中进行比对，得到富集结果见表2、表3。GO分析结果表明，前列腺癌细胞较前列腺正常细胞上调的差异基因主要富集的细胞活动过程有:白细胞迁移、细胞趋化性、细胞粘附、外肽酶活性、细胞-细胞连接。FFAR2、THBS4、TRPM4、CLDN3、CLDN8以及HPN被富集到多条通路。FFAR2、HBS4和TRPM4三个基因与白细胞迁移与细胞趋化性有关，白细胞迁移，可能导致前列腺癌组织中的白细胞增多，白细胞产生白介素，调控多种生理生化反应。该样本中前列腺癌样本集中于T2、T3分期，该时期的前列腺癌存在转移潜能，因此可能与细胞趋化性有关。CLDN3和CLDN8是Claudin家族基因，该基因编码的蛋白由Shoichiro Tsukita及其同事在1998年发现，是细胞紧密连接的重要分子，已有报道称Claudin-1在结肠癌、Claudin-10在肝细胞癌、Claudin-18在胃癌中具有一定的临床价值[9-11]。HPN基因又叫Hepsin基因，该基因编码一种II型跨膜丝氨酸蛋白酶，该蛋白酶可能参与多种细胞功能，包括凝血和维持细胞形态。编码蛋白的表达与癌症，尤其是前列腺癌的生长和发展有关[12]。KEGG富集分析结果表明，差异表达的基因主要集中在紧密连接信号通路、多种生物分子代谢信号通路（在此列举一条α-亚麻酸代谢信号通路）、细胞粘附分子（CAMs）信号通路、黏着力信号通路、维生素消化吸收信号通路。除GO分析结果涉及的基因外，KEGG分析中还出现了PLA2G2A、FOLH1两个基因。PLA2G2A基因编码的蛋白是磷脂酶A2家族（PLA 2）的成员。该基因产物属于Ⅱ类，含有分泌型PLA 2，这是一种低分子质量的胞外酶，需要钙离子进行催化。也可催化磷酸甘油中sn-2脂肪酸酰基酯键的水解，释放游离脂肪酸和溶血磷脂，并参与生物膜磷脂代谢的调控[13]。同时，通过富集的结果来看，该基因还参与其他生物大分子如亚油酸代谢、脂肪消化吸收、醚脂代谢、花生四烯酸代谢、甘油磷脂代谢。而脂肪酸的氧化代谢过程已被证实与前列腺癌的发生和发展有着密切联系[14]。FOLH1基因编码属于M28肽酶家族的Ⅱ型跨膜糖蛋白。该蛋白以谷氨酸羧肽酶的形式存在于不同的替代底物上，包括营养叶酸和神经肽N-乙酰-1-天冬氨酰-1-谷氨酸，在前列腺、中枢神经、外周神经系统和肾脏等多种组织中均有表达。在前列腺中，该基因编码的蛋白质（PSMA）在癌细胞中被上调，并被用作前列腺癌的有效诊断和预后指标[15]。