《电子计算机在遗传育种中的应用》

目录1

第一章育种的数量遗传学基础知识1

第一节加性效应、显性效应和上位性效应1

第二节主要育种世代平均值的遗传组成4

一、不分离世代的平均值组成4

二、分离世代的平均值组成4

一、表型相关、遗传相关和环境相关 U5

二、F2代7

第三节各主要世代方差、协方差的遗传组成7

一、不分离世代7

三、F3代8

四、F2代个体与F3家系平均值的协方差10

五、回交世代11

第二章植物育种试验的方差分析和协方差分析14

第一节单因素单向分组方差分析14

第二节单因素双向分组的方差分析18

一、小区内无重复观察值18

二、小区内有重复观察值23

第三节单因素单向分组的协方差分析27

第四节单因素双向分组的协方差分析29

一、小区内元重复观察值29

二、小区内有重复观察值32

三、单因素单向分组协方差分析中遗传协方差COV(g)的估计35

第五节 遗传方差和遗传协方差的估计35

一、单因素单向分组方差分析中遗传方差σx2的估计35

二、单因素双向分组方差分析中遗传方差σx 2的估计35

一、单因素单向分组方差分析程序：ANOVA2·BAS36

四、单因素双向分组协方差分析中遗传协方差COV(g)的估计36

第六节程序使用说明及程序清单36

二、单因素双向分组方差分析程序一：ANOVA1·BAS37

三、单因素双向分组方差分析程序二：ANOVA3·BAS37

四、单因素双向分组协方差分析程序：COVAN·BAS38

第三章遗传力48

第一节遗传力及其估算原理和方法48

一、遗传力的概念48

二、遗传决定度和遗传力的估算49

第二节遗传力在育种上的应用59

一、遗传力在育种上应用的几个方面59

二、正确理解和应用遗传力61

第三节程序使用说明及程序清单62

第四章模型测验和世代平均值分析70

第一节 模型测验和联合尺度测验70

一、模型测验70

二、联合尺度测验74

第二节世代平均值分析77

一、六参数模式77

二、五参数模式81

三、三参数模式82

第三节程序使用说明及程序清单82

一、简单尺度检验程序：ABCD·BAS82

二、世代平均值分析程序：PAREST·BAS83

三、联合尺度检验程序：JOINT·BAS84

第五章育种工作中的多元回归分析95

第一节多元线性回归95

一、多元线性回归方程95

二、多元线性回归方程的方差分析99

三、复相关系数100

四、多元线性回归分析在育种中的应用100

第二节逐步回归101

第三节程序使用说明及程序清单107

第六章相关和通径分析115

第一节遗传相关115

二、遗传相关与间接选择121

第二节通径分析122

一、通径和通径系数的概念123

二、通径分析 通径系数及多元决定系数的计算125

三、通径分析在遗传育种上的应用130

第三节程序使用说明及程序清单132

一、简单相关分析程序：SINCOR·BAS132

二、遗传相关分析程序：PGRA·BAS132

三、通径分析程序：PATHCO·BAS133

第七章配合力分析146

第一节配合力的概念及配合力研究方法146

一、配合力的概念146

二、配合力研究方法147

第二节GRIFFING配合力分析方法148

一、GRIFFING配合力分析的统计模型148

二、原始数据的方差分析和配合力分析149

三、方法1的统计分析152

四、方法2的统计分析162

五、方法8的统计分析168

六、方法4的统计分析176

第三节两组亲本杂交的配合力分析182

一、原始数据的方差分析184

二、第一种情况的配合力分析185

三、第二种情况的配合力分析189

四、第三种情况的配合力分析192

五、第四种情况的配合力分析193

六、两组亲本杂交配合力分析方法举例195

第四节程序使用说明及程序清单201

一、GRIFFING配合力分析方法1程序一：GR FI·10202

二、GRIFFING配合力分析方法1程序二：GRIFI·A10205

三、GRIFFING配合力分析方法2程序一：GRIFI·20206

四、GRIFFING配合力分析方法2程序二：GRIFI·B20208

五、GRIFFING配合力分析方法3程序一：GRIFI·30208

六、GRIFFING配合力分析方法3程序二：GRIFI·C30209

七、GRIFFING配合力分析方法4程序一：GRIFI·40210

八、GRIFFING配合力分析方法4程序二：GRIFI·D40210

九、两组亲本杂交的配合力分析程序（1）：PQCA·BAS211

十、两组亲本杂交配合力分析程序（2）：PQCAB·BAS213

第八章选择指数和相关遗传力301

第一节选择指数的基本理论302

一、选择指数的构造302

二、选择指数的遗传力及聚？遗传型的预期遗传进展305

第二节选择指数的分析方法及其应用307

第三节相关遗传力及其应用315

一、相关遗传力的概念316

二、相关遗传力的应用316

第四节程序使用说明及程序清单324

一、改进单一目标性状的一般选择指数程序一：SELIND·COM324

二、改进单一目标性状的一般选择指数程序二：INDEX3·COM326

三、改 聚合遗传型的综合选择指数程序一：INDEX·COM（适用于重复次数R≠1的试验）327

四、 进聚合遗传型的综合选择指数程序二：INDEX5·COM〔适用于不设重复（R=1）的328

试验〕328

五 相关遗传力分析程序：CORHH·COM329

第九章区域式验的方差分析及品种的稳定性376

第一节 品种区域试验的方差分析376

、一年一地试验（品种比较试验）376

、一年多地试验377

、多年多地试验383

二、稳定性参数估计393

一、EBERHART和RUSSELL稳定性分析模型393

第二节品种的稳定性393

三、稳定性参数的显著性检验395

四、稳定性分析举397

第三节程序使用说明及程序清单402

一、一年多地试验方差分析程序：AOVFR1·COM402

二、多年多地试验方差分析程序：AOVFR2·COM403

三、稳定性分析程序：EBERHE·RT405

第十章遗传距离测定及其在育种中的应用433

第一节遗传距离的概念433

第二节主成分分析435

一、主成分分析的数学描述435

二、主成分的性质438

三、主成分的计算439

第三节遗传距离测定439

一、数量性状的选择和调查方法439

二、方差—协方差分析439

三、遗传相关矩阵的估算439

四、计算特征方程（R-λI）L＇=0〔即(∑-λI)L＇=0〕的特征根和特征向量440

五、计算主成分值440

六、求性状与主成分的相关系数及性状对主成分的给予率441

七、计算遗传距离441

第四节聚类分析446

一、系统聚类简介447

二、3种常用的类间距离的计算方法448

三、利用谱系图对样本进行分类452

四、系统分类法的比较454

第五节遗传距离应用中的几个问题455

一、性状的数量化455

二、性状的选择与调查455

三、方法问题455

第六节遗传距离与聚类分析在育种中的应用456

一、研究亲本选配和亲本分类456

一、主成分遗传距离估测程序一：PAV·COM460

第七节程序使用说明及程序清单460

二、研究环境分类460

二、主成分遗传距离估测程序二：PCH1·COM461

第十一章典范相关分析及其在遗传育种中的应用498

第一节典范相关分析498

第二节典范性状及典范遗传距离505

一、典范性状及其遗传力505

二、典范遗传距离508

三、应用举例509

第三节典范选择指数515

一、间接遗传系数515

二、典范选择指数516

第四节程序使用说明及程序清单521

一、典范性状及典范遗传距离程序：PAV33·COM521

二、典范选择指数程序：CANOAN·COM522

三、典范选择指数程序：CANOSE·COM525

附录：矩阵代数571

附表1 学生氏t值表（两尾）585

附表2 5％（上）和1％（下）点F值（一尾）表585

附表3 x2值表（一尾）592

附表4 Duncan＇s新复极差测验5％和1％SSR值表593

附表5 选择率与选择强度的关系595

参考文献596