《表2 SSR标记的检测结果》

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《辣椒疫病抗性关联分析及优异等位变异挖掘》


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a:未作特别标注的均为在辣椒NCBI Zunla 1 Ref_v1.0参考基因组中的物理位置;*:在Zunla 1 Ref_v1.0中未能匹配到染色体,在辣椒CM334v1.55参考基因组中的物理位置;-:物理位置未知

58对引物组合从194份辣椒种质材料中共检测到178个等位变异(表2),平均每对引物检测到3.1个,其中多态性最高的引物是Hpms Ca SIG19和CAMS-336,能检测到7个等位变异;多态性最低的是Hpms AT2-14和Hpms2-26,只能检测到1个等位变异。Shannon指数变幅为0~1.3677,平均值为0.6732;多态信息量(PIC)变幅为0.0565~0.7045,平均值为0.3859;基因多样性变幅为0.0582~0.7439,平均值为0.4400。