《表1 mi R-34a甲基化引物信息》

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《结直肠癌组织miR34a启动子区甲基化状态的临床意义探讨》


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采用甲基化特异性PCR(MSP)法。通过在线Meth-Primer软件(http://www.urogene.org/methprimer/)设计甲基化、非甲基化序列的引物(其信息见表1[5]),以亚硫酸氢钠修饰后的DNA为模板进行PCR扩增:95℃预变性10min,94℃15s,共40个循环;55℃30s,72℃40s,再72℃延伸10min。非甲基化扩增体系的退火温度提高至56℃,其他步骤相同。扩增产物为2.5%琼脂糖凝胶电泳,紫外光照射显带。RT-PCR:取1~2μl甲基化修饰型DNA进行PCR,扩增产物为2.5%琼脂糖凝胶电泳,然后紫外光照射显带,确定与引物互补的DNA序列甲基化状态。对PCR产物进行电泳,并根据电泳条带情况进行判定:(1)甲基化特异性引物扩增出目的条带,而非甲基化特异性引物未扩增出条带,为甲基化;(2)非甲基化特异性引物扩增出目的条带,而甲基化引物未扩增出条带,为非甲基化;(2)对引物均能扩增出目的条带的半甲基化,判断为甲基化。