《表4 小麦农艺性状稳定关联的位点信息》

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《普通小麦主要农艺性状的全基因组关联分析》


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各性状详细名称见表2。Name of each trait is given in Table 2.

针对不同性状选用其最优关联模型进行GWAS分析,共检测到652个显著SNP位点(P≤0.001),其中21个SNP在2个或2个以上的环境中被检测到,属于稳定的SNP标记(表4)。检测到与穗下节长稳定关联的标记4个,分别位于2D(1)、6A(1)和6B(2)染色体上,其中AX-94532508、AX-94976370和AX-94918690在3个环境中被重复检测到,AX-95108722在2个环境中被重复检测到,可解释7.68%~10.51%的表型变异。检测到与穗粒数稳定关联的标记4个,位于5B(3)和7D(1)染色体上,均在2个环境中被重复检测到,R2范围为7.67%~10.97%。7D染色体上的AX-95152265和1A染色体上的AX-95094324分别与千粒重和株高稳定关联,均能在3个环境中稳定遗传,分别解释9.16%~10.84%、8.18%~12.41%的表型变异。检测到与穗长稳定关联的标记2个,位于2D(1)和3A(1)染色体上,均在2个环境中被重复检测到,R2范围为9.89%~14.27%。检测到与可育小穗数相关联的稳定标记2个,位于5B染色体上,均在3个环境中被重复检测到,R2范围为7.69%~11.50%。检测到与抽穗期相关联的稳定标记10个,分别位于1B(4)、2A(3)、5A(1)和7D(1)染色体上,AX-95197628、AX-95073002、AX-94430515、AX-94690816、AX-94402434和AX-95629896在2个环境中被重复检测到,AX-94748775、AX-94629503、AX-94446915和AX-94639471在3个环境中被重复检测到,可解释8.07%~18.79%的表型变异,其中AX-95629896在物理图谱上没有位置信息。没有检测到与每平方米穗数和粒宽稳定关联的SNP。