《表1.健康烟株与青枯病感病烟株各部位细菌群落不同分类水平数量》

《表1.健康烟株与青枯病感病烟株各部位细菌群落不同分类水平数量》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《健康与感染青枯病烟株根际土壤与茎秆细菌群落结构与多样性》


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Venn图分析结果表明(图1),在属和OTU水平,感染青枯病组与健康烟株组的根际土壤之间细菌种类较为接近,共有的属和OTU种类远高于两组样品独有的种类。ZCTU与GBTU两组样品之间共有属主要包括:劳尔氏菌属(Ralstonia)、鞘脂单胞菌属(Sphingomonas)、假单胞菌属(Pseudomonas)、黄杆菌属(Flavobacterium)、芽单胞菌属(Gemmatimonas)、金黄杆菌属(Chryseobacterium)、代尔夫特菌属(Delftia)、鞘脂菌属(Sphingobium)等;ZCTU样品中独有属包括:Phascolarctobacterium、Moryella、Nannocystis、Lachnospira、Luteibacter、Sinomonas、Blautia、Skermanella、罗氏菌属(Roseburia)等;GBTU样品中独有的属包括:Siphonobacter、Parafilimonas、Brevifollis、Lactococcus、Streptococcus、Candidatus_Profftella、Exiguobacterium、鞘藻属(Microcoleus)、Polycyclovorans。发病茎杆部位与健康茎杆、感染青枯病烟株病健交界部位与健康烟株等高对照部位茎杆之间细菌的种类存在较大差异,其中感染青枯病组样品独有的属和OTU种类远高于两组共有的和健康烟株组样品独有的细菌种类。ZCJ与GBJ两组样品之间共有的属主要包括:劳尔氏菌属、假单胞菌属、拉克氏梭状芽胞杆菌属(Lachnocloatridium)、肠杆菌属(Enterobacter)等;ZCJ样品独有的属包括:Moryella、Romboutsia、Blautia、乳酸杆菌属(Lactobacillus)、Akkermansia、毛螺菌属(Lachnospira)、拟杆菌属(Bacteroides)、肠球菌属(Enterococcus)、罗氏菌属等;GBJ样品独有的属包括:Devosia、Herminiimonas、Mitsuaria、假诺卡氏菌属(Pseudonocardia)、Opitutus、Holophaga、Siphonobacte、噬细胞菌属(Cytophaga)、Skermanella等。ZCJ2与GBJ2两组样品之间共有的属主要包括:罗氏菌属、肠杆菌属、泛菌属(Pantoea)等;ZCJ2样品独有的属包括:假丁酸弧菌属(Pseudobutyrivibrio)、Paraprevotella、Parabacteroides、Moryella、Dietzia、罗氏菌属、短状杆菌属(Brachybacterium)、普罗威登斯菌属(Providencia)、毛螺菌属等;GBJ2样品独有的属包括:Devosia、Herminiimonas、Massilia、Romboutsia、Candidatus_Solibacter、假诺卡氏菌属、Holophaga、Skermanella、诺卡氏菌(Nocardioides)等。感染青枯病烟株根际土壤细菌种类最多,其次为茎杆发病部位,病健交界部位茎杆的细菌种类最少。GBTU、GBJ和GBJ2三组样品共有的属主要包括:罗氏菌属、假单胞菌属、Lachnocloatridium、肠杆菌属、代尔夫特菌、黄杆菌属等;GBJ样品独有的属包括:无色杆菌属(Achromobacter)、Nannocystis、Salana、诺卡菌属(Nocardia)、Aliihoeflea、Collinsella;GBJ2样品中独有的属包括:Blautia、双歧杆菌属(Bifidobacterium)、螺杆菌属(Helicobacter)、Allobaculum、Alistipes、发光杆菌属(Photobacterium)、拟杆菌属、丙酸杆菌属(Propionibacterium)、脲原体属(Ureaplasma)等。健康烟株组同样为根际土壤细菌种类最多,但与发病烟株病健交界等高的健康烟株茎杆部位样品(ZCJ2)细菌种类高于感病茎杆对照部位样品(ZCJ)。ZCTU、ZCJ和ZCJ2三组样品共有的属主要包括:劳尔氏菌属、肠杆菌属、泛菌属、鞘脂单胞菌属等;ZCJ中独有的属包括:Ruminiclostridium_6、Akkermansia、Coriobacteriaceae_UCG-002、Rothia、Prevotella_9、Subdoligranulum。ZCJ2中独有的属包括:假丁酸弧菌属(Pseudobutyrivibrio)、Paraprevotella、Parabacteroides、Dietzia、产碱杆菌属(Alcaligenes)。